隈重信的親自詰問，新任大審院院長兒島惟謙搬出大隈重信自己牽頭制定的《明治憲法》，義正言辭說：“憲法規定政府施政必須完全遵守法律，不得玩弄法律於股掌間。我們當法官的，維護法律的尊嚴，就是維護國民的尊嚴！”
日本首相大隈重信自己也很為難，幾乎用央求的語氣對兒島惟謙院長說：“我何嘗不知道法律代表國民的尊嚴，但是事態緊急，搞不好日本有滅國之災，還請法網開一面。”
兒島惟謙不以為然，拒絕道：“法網恢恢，疏而不漏，要是開了口子，那以後漏網之魚就會如過江之鯉。”
日本首相大隈重信疾呼“日本離亡國不遠矣！你將是日本的罪人！老夫只好去見天皇，求他下令了。”
“日本國的憲法規定，就算天皇也不能違反憲法。”兒島惟謙“哼”了一聲，拂袖而去。
大隈重信見兒島惟謙太過頑固，只好親自出馬，同時向7位主審法官施壓。多數法官在首相大隈重信強大壓力下，立場搖擺，同意尊重日本內閣的重判主張。
兒島惟謙竭力向7位法官痛陳利害，希望一同堅守好司法**於行政這最後的底線。他鼓勵法官：“既然法無明文規定，就不能草率判處死刑。應該堅持原則，拒絕向政治壓力屈服。諸君，捍衛司法**，捨我其誰？不然，法網一開，我等以何面目面對國民？”
大隈重信聞訊，心慌不已，立即派出內務大臣西鄉從道與法務大臣山田顯義二人，聯手向七位法官遊說。沒想到，7位法官以司法**為由，拒絕在審判前與西鄉從道等行政官員見面。
西鄉從道也是日本的戰爭狂人，他覺得俄國人不敢打到日本本土來，也就沒當回事，回去回覆大隈重信，說：“大不了，就開戰！大日本帝國怕過誰？”
“糊塗！”大隈重信厲聲說：“你們這是要毀掉日本國！”
大隈重信連夜去找日本總檢察長三好退藏與法務大臣山田顯義，讓他們儘快干涉主審法官兒島惟謙。
5月25日，日本總檢察長三好退藏與法務大臣山田顯義聯名釋出敕令，規定刑法第116條可以進行擴張解釋，意欲向以“大逆罪”處決罪犯津田三藏死刑。
兒島惟謙還不買賬，對報紙回應道，日本刑法總則第三條白紙黑字規定了禁止法律溯及既往原則，新敕令無法適用於“大津案”。
津田三藏在牢獄中，聽聞國家要判處自己死刑，怎麼也想不通，“我是愛國的，國家為什麼反而要我死？這世上還有天理嗎？”
不過，在5月27日，兒島惟謙擔任院長的日本特別法庭判決出爐。就算是在日本首相和政府的重重壓力下，日本大審院特別審判庭判決還是**的，他們毅然下判：“被告津田三藏犯下刑法第292條謀殺未遂罪，處以終身苦役。刺客津田三藏發監於北海道釧路監獄。”
津田三藏竟然沒有被判死刑，判決一出，整個世界轟動了，俄國人再一次受到了愚弄。而在日本國，司法獨立於行政權，初現端倪，兒島惟謙竟受到日本和英國、美國輿論的普遍讚揚。而日本外交大臣青木周藏、內務大臣西鄉從道、法務大臣山田顯義三人由於插手司法東窗事發，相繼宣佈辭職，當了替罪羊。
中國駐日本大使李經方將案情的經過和判決電報告知李經述，並說：“日本人這是在找死。法官這麼頑固不化，遲早亡國！”
馮國璋當時在李經述身邊，看了電報，也說日本**官兒島惟謙的行為只能用“愚蠢”來形容，這下子日俄之間可有好戲看了。
“這正是日本人的可怕之處！”李經述倒是對兒島惟謙的行為表示理解與讚賞，嚴肅地回答說，他同時也強烈意識到，必須立即聯絡俄國跟日本開戰了，不然，再過十年，別說是大清國，就算俄國人也未必是日本的對手