擊退神秘勢力後，聯盟上下迅速投入到緊張的戰後重建工作當中。
工程隊伍忙碌地穿梭在聯盟總部各處，運用先進的修復技術和材料，對那些受損嚴重的建築進行修復。建築機器人有條不紊地清理著廢墟殘骸，將一塊塊破碎的牆體、零件搬運到指定的回收區域，同時按照預設的藍圖，重新搭建起堅固的框架結構。科研人員們則在臨時搭建的實驗室裡，爭分奪秒地搶修和除錯那些受損的科研裝置，一些珍貴的資料雖然在襲擊中部分丟失，但好在之前有做過備份，此刻大家正仔細核對，確保研究工作能夠儘快恢復正軌。
醫療團隊也全員出動，悉心照料著受傷的人員。他們運用各種先進的醫療手段，從細胞修復技術到能量治療儀器，盡力讓每一位傷員都能儘快康復。整個聯盟總部雖然遭受重創，但此刻卻充滿著一種堅韌不拔、積極恢復的氛圍。
與此同時，聯盟高層召開緊急會議，商討如何強化防禦力量，以應對未來可能出現的類似危機。
林風在會議上提出了自己的想法：“這次神秘勢力能突襲成功，很大程度是因為我們的通訊和預警系統存在漏洞，我們需要對其進行全面升級，採用多套冗餘備份系統，並且利用神源之球的能量特性，設定加密防護，讓敵人難以輕易干擾破壞。”
眾人紛紛點頭表示贊同，科研團隊當即接下了這個任務，開始著手研究如何將神源之球的能量與通訊、預警系統完美融合，打造出更加穩固且智慧的防護機制。
“還有，我們的戰艦防禦和攻擊能力也得進一步提升。”護衛艦隊指揮官接著說道，“可以參考這次戰鬥中敵人戰艦的特點以及我們自身暴露的問題，加厚戰艦護盾，最佳化能量武器的能量輸出效率，並且增加一些具備特殊功能的防禦和攻擊模組。”
聯盟高層經過商議後，批准了這個提議，劃撥了大量的資源給科研團隊和軍工部門，支援他們對戰艦進行升級改造。軍工部門迅速行動起來，召集了眾多頂尖的工程師和技術專家，依據制定好的方案，對每一艘戰艦進行細緻的改裝。
在戰艦的護盾方面，他們採用了一種全新的能量複合結構，這種結構能夠在遭受攻擊時，自動調整能量分佈，將受到的衝擊力均勻分散，極大地增強了護盾的抗打擊能力。對於能量武器，科研人員透過最佳化內部的能量傳導線路和能量激發裝置，使武器的能量輸出效率提升了近一倍，攻擊威力更加強大。同時，還在戰艦上安裝了一些新研發的特殊模組，比如能夠短暫扭曲周邊空間，讓敵方攻擊落空的空間閃避裝置，以及可以發射出干擾敵方戰艦能量系統的能量脈衝裝置。
經過一段時間的努力，聯盟總部的建築逐漸修復完畢，煥然一新，科研裝置也都重新投入使用，各項研究工作繼續穩步推進。而戰艦的升級改造工作也接近尾聲，一支支經過強化的護衛艦隊整齊地排列在聯盟總部周邊的宇宙空間中，散發著強大的氣息，彷彿在向整個宇宙宣告著聯盟的堅韌與不可侵犯。
然而，就在聯盟忙於自我強化之時，宇宙深處，那些神秘勢力在失敗後並未善罷甘休，他們暗中聯合了更多的邪惡勢力，正在謀劃一場更大規模、更加縝密的攻擊計劃，一場新的風暴正在悄然醞釀，而聯盟對此還一無所知，依舊沉浸在重建防禦成功的喜悅之中，只是不知當新的危機真正降臨之時，他們又能否再次成功應對，一切都還是未知數，緊張的氛圍如同隱藏在暗處的陰霾，又開始慢慢地在這看似平靜的局勢下蔓延開來。