在民生問題解決了以後，李旭終於開始對軍隊動手了，不動手不行，大明如今的軍制很不平衡，各戰區統帥權力太大，如果不加以控制，後果不堪設想。
這不是忠誠度的問題，李旭作為大明第一任皇帝，他定的政策那對於後世的皇帝來說，那就是祖制，輕易不能更改的，所以他不得不未雨綢繆。
各戰區統帥會一直忠心嗎？那必然是不會的，就不說十年二十年後了，就是李旭前腳剛走，有人就開始造反也不是不可能的。
忠誠？只是建立在背叛的籌碼不夠多而已，真有一天，潑天富貴唾手可得，有幾人能忍住？不要試探人心，人心是最經不住考驗的東西了。
李旭考慮了幾次，最後還是沒有選擇遷都，因為代價太大了，勞民傷財得不償失，如今大明還屬於休養生息階段，這種大規模的遷移活動還是不適合執行的。
大明統一了中原後，對治轄區域進行了重新劃分，大明的行政單位被分為：三都、八府、十八行省、四個自治區加一個特別行政區。
三都分別是：東都濮陽、南都洛陽、西都長安城。
八府分別是：太原府、邯鄲府、鄴城府、上京府、燕京府、京兆府（原開封）、成都府、襄陽府。
十八行省分別是：河北行省、山東行省、山西行省、河南行省（山河行省互不嘲諷條約必須遵守）、關中行省、陝北行省、東燕行省、南燕行省、南楚行省、南陳行省、南漢行省、北漢行省、南梁行省、魏博行省、西晉行省、北魏行省、南魏行省、京畿行省。
四大自治區分別是：匈奴自治區、烏桓自治區、蒙古自治區、眾族自治區。
一個特別行政區是：東瀛特別行政區，其下轄東瀛本島、海外三島、舟山群島等東海所有島嶼。
對軍隊的改革主要針對上層，軍隊的本體結構還是沒變，不過撤銷了集團軍編制，最高編制為軍團，每個軍團由原來的四軍制改成了兩軍制，而且軍隊的人數也做了調整，每軍滿員只有一萬兩千五百人，這樣下來一個軍團只有兩萬五千人，大大削弱了軍團長的權利。
每軍的人數減少了，相應的軍團的數量就增加了，大明重新設定了四十個軍團，軍團長的職位由都督擔任，各都督又由五軍都督府管轄。
在每個行省、府、都、常年駐守一個軍團，這樣下來就得二十九個軍團，其餘十一個軍團，東都濮陽增加五個個，其餘兩都每都增加三個。
海軍的六個艦隊也開始重新劃分，每兩個小艦隊組成一箇中型艦隊，三個中型艦隊分別駐守東瀛、大明沿海港口、南洋地區，海軍也由五軍都督府管轄。
騎兵也進行了重組，每兩萬騎兵組成一個騎兵軍團，共計八個軍團，其中四個軍團負責防守四個自治區，還有一個軍團坐鎮四個自治區中央以防不測，西域地區還有一個軍團駐守，剩下兩個軍團則是駐守在大明帝都濮陽。
大明九個統帥中，盧植屬於養老人員，基本上很少插手軍事，姜維隱退，鄧艾被降職，只剩下曹真、徐榮、陸遜、關羽、黃忠、周瑜、張遼七人。
這七人中，關羽黃忠都是要跟隨李旭走的，所以也不能算在內，李旭又提拔了一批在統一戰爭中，表現很出色的將領加上其餘四個統帥，組成五軍都督府。
被提拔的將領中，陸軍中有：高順、夏侯惇、夏侯尚、曹休、魏延、魯肅。
騎兵中有：趙雲、曹純、曹洪。
海軍中有：太史慈、淩統、周泰。
五軍都督府是由陸軍最高統帥部、騎兵統帥部、海軍統帥部、衛戎司令部、斥候通訊部組成。
大明的軍政徹底分離，全國軍隊將由五軍都督府管轄，軍事戰爭、佈局規劃、人員調遣、人員升遷、戰功統計、人員考核都由五