胭齋”所作的批語，也就是所謂脂批。這些脂批明確告訴我們〈紅樓夢〉是有原型的。如：
第十三回秦可卿託夢給鳳姐，說道：“若應了那句‘樹倒猢猻散’的俗語，豈不虛稱了一世讀書舊族了！”脂批批道：“‘樹倒猢猻散’之語，今猶在耳，屈指三十五年矣。哀哉傷哉，寧不痛殺！”
第十六回寫曹家準備迎接元妃歸省，脂胭齋回前總批：“借省親事寫南巡，出脫心中多少憶昔感今。”
第二十八回，寫寶玉等人在馮紫英家喝酒，寶玉道：“我先喝一大海，發一新令，有不遵者，連罰十大海，逐出席外與人斟酒。”有兩條批語：
“大海飲酒，西堂產九臺靈芝日也。批書至此，寧不悲乎？壬午重陽日”（庚辰本眉批）
“誰曾經過？嘆嘆！西堂故事。”（甲戌本側批）
那麼，《紅樓夢》到底說的是誰的事呢？我們先介紹索隱派的觀點。
（1）認為《紅樓夢》寫的是清世祖與董鄂妃之事。晚清著名學者王夢阮寫了一本《紅樓夢索隱》，他認為《紅樓夢》“全是為清世祖與董鄂妃而作，兼及當時的諸名王奇女。”他說，董鄂妃即是秦淮名妓董小婉，本是當時名士冒闢疆的妾，後來被清兵奪去，得到清世祖的喜愛，封為貴妃。後來董妃夭死，清世祖痛不欲生，跑到五臺山做和尚去了。《紅樓夢》即寫他們的事情，清世祖就是賈寶玉，董鄂妃就是林黛玉。黛玉是所以叫“黛玉”，是因為她是“代”董小宛的。清世祖就是順治皇帝，康熙帝的父親，他後來出家了。關於《紅樓夢》一書是否是王夢阮索隱出來的清世祖與董小宛的傳記，孟森在他的《董小宛考》裡已作了翔實的論述。他用詳實的材料證明了清世祖出生時，董小宛已十五；清世祖七歲登基時，董小宛已二十一歲；等到清世祖八年十四五歲時，董小宛卻死於此年，其時二十八歲。由此足以說明王夢阮的《紅樓夢》為清世祖和董小宛之作純屬無稽之談。
（2）認為《紅樓夢》是清康熙朝政治小說。五四時期的北京大學校長蔡元培寫了一本《石頭記索隱》，他說：“《石頭記》。。。。作者持民族主義甚摯。書中本事在吊明之亡，揭清之失。”他認為，書中“紅”字多隱“朱”字，朱者，明也，漢也。寶玉有“愛紅”之癖，言以滿人而受漢族文化也。書中女子多指漢人，男子多指滿人，所以寶玉說“女子是水做的骨肉，男人是泥做的骨肉”。同時他考證出《紅樓夢》中人物的原型。如寶玉是康熙的廢太子胤（衤乃），黛玉是朱竹（土宅），寶釵是高士奇等等。
蔡元培又說：“書中‘紅’字多影‘朱’字，朱者，明也，漢也。寶玉有愛紅之癖，言以滿人愛漢族文化也；好吃人口上胭脂，言拾漢人唾餘也……寶玉在大觀園中所居曰怡紅院，即愛紅之義。所謂曹雪芹於悼紅軒中增刪本書，則吊明之義也。本書有《紅樓夢曲》，以此。書中序事託為石頭所記，故名《石頭記》。其實因金陵亦曰石頭城而名之。……又曰《情僧錄》及《風月寶鑑》者，或就表面命名，或以‘情’字影‘清’字；又以古人有‘清風明月’語，以‘風月’影‘明清’亦未可知也。”“《石頭記》敘事自明亡始。第一回所云，這一日三月十五日葫蘆廟起火，燒了一夜，甄氏燒成瓦礫場。即指甲申三月間明愍帝殉國，北京失守之事也……甄士隱隨跛足道人而去，言明之政事隨愍帝之死而消亡也。”“甄士隱即真事隱，賈雨村即假語存，盡人皆知。然作者深信正統之說，而斥清室為偽統，所謂假府即偽朝也。其人名如賈代化，賈代善，謂偽朝之所謂化，偽朝之所謂善也。賈政者偽朝之吏部也，賈敷、賈敬偽朝之教育也（《書》曰“敬敷五教”）。賈赦偽朝之刑部也……賈璉為戶部……李紈為禮部（李禮同音）”。“作者於漢人之服從清室而安富尊榮者，如洪承疇、范文程之類，以嬌