杏代表之。僥倖嬌杏即書中敘新太爺到任，即影滿洲定鼎……姽嫿將軍林四娘，似以代表起義師而死者。敘尤三姐，似以代表不屈於清而死者。敘柳湘蓮，似以代表遺老之隱於二者也……以民族對待言之，征服者為主，被征服者為奴。本書以男女影滿漢，以此”（以上錄自《石頭記索隱&；#8226；紅樓夢考證》第6～9頁）。
蔡元培依據他以上的主張，又按照他的三法推求，即一、品性相類者；二、軼事有徵者；三、姓名相關者（見同書第一頁蔡元培《第六版自序》）得出幾條結論：
“賈寶玉言偽朝之帝系也。寶玉者，傳國璽之意也，即指‘胤（礻＋乃）’”（見9頁）。
“《石頭記》敘巧姐事，似亦指胤（礻＋乃）。‘巧’與‘（礻＋乃）’字形相似也”（12頁）。
“林黛玉影朱竹坨也。絳珠影其氏也，居蕭湘館影其竹坨之號也。竹坨生於秀水，故絳珠草長於靈河岸上……”（見13頁）。
“薛寶釵高江村也（徐柳泉已言之）。薛者，雪也。林和靖《詠梅》有曰‘雪滿山中高士臥，月明林下美人來。’用‘薛’字以影江村之姓名也（高士奇）”（見14頁）。
“探春影徐健庵也……”（見18頁）。
“王熙鳳影餘國柱也……”（見26頁）。
“史湘雲影陳其年也……”（見24頁）。
“妙玉影姜西溟也……”（見28頁）。
“惜春影嚴蓀友也……”（見33頁）。
“寶琴，冒闢疆也……”（見34頁）。
“劉姥姥，湯潛庵也……”（見35頁）。
蔡元培在他的《石頭記索隱》裡雖也反對牽強附會，如說太平閒人“遂有種種可笑之傅會”，但蔡元培在花費很大的時間也在進行著附會，也就是胡適所說的那樣“不去搜求那些可考定《紅樓夢》的著者、時代、版本等等材料，卻去收羅許多不相干的零碎史事來附會《紅樓夢》裡的情節，他們並不曾做《紅樓夢》的考證，其實只做了許多《紅樓夢》的附會”。胡適的這種結論，特別是指對蔡元培的研究，是很有道理的。
（3）認為《紅樓夢》是記納蘭成德的事。其派各家雖看法有異，但大致相同，並沒有逃出納蘭成德這一範疇。納蘭成德，字容若，是康熙朝宰相明珠的兒子。陳康祺的《郎潛記聞二筆》（即《燕下鄉坐（目＋坐）錄》）卷五說：先師徐柳泉先生雲：“小說《紅樓夢》一書即記故相明珠家事；金釵十二，皆納蘭侍御（成德宮侍御）所奉為上客者也。寶釵影高澹人，妙玉即影西溟（姜宸英）。……”徐先生言之甚詳，惜餘不盡記憶。
俞樾的《小浮梅閒話》（《曲園雜纂》38頁）說： 《紅樓夢》一書，世傳為明珠之子而作。……明珠子成德，字容若。《通志堂經解》每一種有納蘭成德容若序，即其人也……然則其中舉止十五歲，於書中所述頗合也。”
以王夢阮、蔡元培為代表的紅學家，一般被稱為“索隱派”。他們之前和之後，“索隱派”的人物和著作還有不少。之前的如署名晶三廬月草舍居士的《紅樓夢偶談》，署名悟真道人的《紅樓夢索隱》；之後的如闞鐸《紅樓夢抉微》（１９２５）、壽鵬飛《紅樓夢本事考》（１９２７）、景梅九《石頭記真諦》（１９３４）等。”索隱派從產生以後可以說綿綿不絕，得出的結論往往出人意表。如有人說，《紅樓夢》其實是在寫唐明皇和楊貴妃，又藉著寫這二人影射清初的多爾袞，是指唐罵清。證據呢，列了一些，比如賈府玉字輩的人物，賈珍、賈珠、賈璉、賈寶玉、賈環，名字連起來是“珍珠連玉環”，這分明是楊貴妃了，又如金陵十二釵，含有“元應李秦王史”，這又說到了李世民；還有人會透過展轉論證，告訴你賈府中的小紅原來是洪